O Museu abriga o Programa de Pós-Graduação em Antropologia Social da Ufam (mestrado e doutorado), biblioteca especializada em assuntos relacionados à Amazônia, divisões de antropologia, arqueologia, difusãocultural, museologia, história e documentação. Conta também com considerável acervo documental, etnográfico e arqueológico, fonte de pesquisas acadêmicas. Organiza e promove exposições temporárias e permanentes, com vistas à divulgação do próprio acervo como também de materiais cuja guarda pertence a outras instituições, além de exposições artísticas que de alguma maneira dizem respeito ao acervo do Museu. Estima-se uma freqüência de 23 mil visitantes anuais aos espaços de exposição do Museu, entre estudantes de nível fundamental e médio, universitários, turistas nacionais e internacionais e a comunidade em geral. Com isso, o Museu Amazônico cumpre a missão de preservação e valorização do patrimônio histórico e cultural da Amazônia.
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